Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ush1cQ9ES64 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ush1cQ9ES64 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms