Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER73

Elp4, Elongator complex protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp4Q9ER73 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Elp4Q9ER73 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Elp4Q9ER73 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms