Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Capn12Q9ER56 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Capn12Q9ER56 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms