Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cpsf1Q9EPU4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cpsf1Q9EPU4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms