Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clstn1Q9EPL2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clstn1Q9EPL2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clstn1Q9EPL2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms