Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sil1Q9EPK6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sil1Q9EPK6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sil1Q9EPK6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms