Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndufs3Q9DCT2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufs3Q9DCT2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms