Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ap3s1Q9DCR2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ap3s1Q9DCR2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms