Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Eif3fQ9DCH4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eif3fQ9DCH4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms