Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ap1s2Q9DB50 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ap1s2Q9DB50 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms