Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samd8Q9DA37 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd8Q9DA37 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms