Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx5Q9D8U8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx5Q9D8U8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms