Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8N1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D8N1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D8N1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms