Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Alkbh4Q9D8F1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Alkbh4Q9D8F1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms