Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Echdc3Q9D7J9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Echdc3Q9D7J9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Echdc3Q9D7J9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Echdc3Q9D7J9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Echdc3Q9D7J9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Echdc3Q9D7J9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Echdc3Q9D7J9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Echdc3Q9D7J9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Echdc3Q9D7J9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms