Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gcc1Q9D4H2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gcc1Q9D4H2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms