Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pramef12Q9D2F1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramef12Q9D2F1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms