Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc6bQ9D289 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms