Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem88Q9D0N8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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