Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx7Q9CY18 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx7Q9CY18 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms