Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RpainQ9CWY9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RpainQ9CWY9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms