Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx10Q9CWT3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx10Q9CWT3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms