Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NmbQ9CR53 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NmbQ9CR53 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms