Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trappc2Q9CQP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trappc2Q9CQP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms