Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mrpl35Q9CQL6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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