Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ndufb9Q9CQJ8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ndufb9Q9CQJ8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms