Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Snrpb2Q9CQI7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpb2Q9CQI7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms