Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ergic3Q9CQE7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ergic3Q9CQE7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms