Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trappc5Q9CQA1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc5Q9CQA1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms