Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg3Q9CPX6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atg3Q9CPX6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms