Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bcl11bQ99PV8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bcl11bQ99PV8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bcl11bQ99PV8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms