Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bhlhe41Q99PV5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe41Q99PV5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms