Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim26Q99PN3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trim26Q99PN3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim26Q99PN3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms