Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Bco2Q99NF1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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Bco2Q99NF1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bco2Q99NF1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco2Q99NF1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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