Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ms4a6bQ99N09 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ms4a6bQ99N09 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms