Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramel1Q99MW3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramel1Q99MW3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms