Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SrrtQ99MR6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SrrtQ99MR6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms