Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gdpd3Q99LY2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gdpd3Q99LY2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms