Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Chmp1b1Q99LU0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chmp1b1Q99LU0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms