Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tnpo2Q99LG2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnpo2Q99LG2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms