Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vmp1Q99KU0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vmp1Q99KU0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms