Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NgrnQ99KS2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NgrnQ99KS2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms