Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Smim11aQ99J19 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim11aQ99J19 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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