Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rnf144aQ925F3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rnf144aQ925F3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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