Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ripply3Q924S9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ripply3Q924S9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms