Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trim7Q923T7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trim7Q923T7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms