Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sirt1Q923E4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sirt1Q923E4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sirt1Q923E4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms