Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nrif1Q923B3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrif1Q923B3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms