Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Trim59Q922Y2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trim59Q922Y2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms