Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gtf3aQ8VHT7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3aQ8VHT7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms